היאריס מחדשת ומפתיעה גם ברמת מנגנוני הבטיחות שהיא מספקת לנוסעים ברכב. טכנולוגיית הבטיחות המתקדמת של טויוטה, הכוללת מערכות A.B.S (Anti-lock braking) ו-E.B.D (Electronic Brakeforce Distribution)
היאריס מצוידת במושבים עם מנגנון להפחתת פגיעות צוואר הנובעות מאלמנט "צליפת השוט" בעת התנגשות מאחור במהירויות נמוכות.
היאריס מאובזרת ב-7 כריות אויר להגנה מירבית על הנוסעים. כריות האוויר כוללות 2 כריות קדמיות לנהג ולנוסע, 2 כריות אוויר צידיות לנהג ולנוסע, 2 כריות אוויר וילון להגנה על הנוסעים מלפנים ומאחור וכרית אוויר לברכי הנהג